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りんごがでている

何か役に立つことを書きます

RユーザーのためのJulia100問100答

R Adevnt Calendar 8日目の記事です。大幅に遅れて大変申し訳ないです。 この記事ではR言語ユーザーのために100問100答形式でJuliaを紹介していこうと思います。 Julia言語 Juliaってどういう言語なの? Juliaは高レベルでハイパフォーマンスな技術計算のため…

Consensus CDSの領域をGRangesオブジェクトにする

Bioconductor - TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneは便利なのですが、ある遺伝子に対応するtranscriptが多すぎてどうしたものかと困ってました。 で、UCSCのゲノムブラウザで見るとConsensus CDS(CCDS)のアノテーションもあるのですが、このBioconductorの…

RStudioから使えるR Markdownで日本語のPDFを作成する

RStudioではRの実行結果を埋め込んでドキュメントやレポートを作成するのにLaTeXベースのものとMarkdown(の亜種のR Markdown)ベースのものが選べるのですが、R Markdownから日本語を含んだレポートをPDF化するのに手間取ったのでその方法を記述します。 私の…